Добрый день!
Давайте начнём с "азов".
"Оферта" - предложение заключить сделку (договор).
"Акцепт" - согласие на заключение сделки на условиях, изложенных в оферте.
Цитата: 1 Можем ли мы составить счет-оферту, но не одну на всех, а брать шаблон и вносить минимальные корректировки под клиента?
Изначально оферта индивидуальная. Это предложение конкретному контрагенту с конкретными условиями.
Безусловно, у каждого предложения могут быть разные условия. Как в мелочах, так и глобально.
Цитата: 2 Достаточно ли отправить этот счет-оферту в электронном виде по e-mail этому клиенту или нужно обязательно на сайте еще где-то ссылку размещать?
Достаточно.
"Массовая оферта, ориентированная на неограниченный круг лиц, называется Публичной офертой. Вот она должна быть доступна всем желающим. В том числе путём размещения на сайте.
А индивидуальную оферту достаточно отправить по почте (на бумаге) или на электронный адрес.
Размещать на сайте ни к чему.
Цитата: 3 Нужно ли отправлять оригинал счета-оферты этому клиенту по почте рф
Не обязательно. По почте можно и сам договор отправить...
Цитата: 4 счет-оферта подписывается клиентом или там только наша печать и подпись
Если клиент подпишет, это уже будет обычный договор. Смысл в оферте теряется.
Оферта - это основа дистанционного способа заключения договора.
Достаточно печати и подписи с Вашей стороны.
Цитата: 5 счет-оферта закрывается актом выполненных работ?
Это зависит от того договора, который Вы заключаете с помощью оферты и акцепта.
Если это подрядный договор, то результат Вы, как подрядчик должны сдать, а заказчик принять. Отсюда и Акт сдачи приёмки выполненных работ.
Но этот Акт двусторонний и требует подписи двух сторон. В Вашем случае это неудобно.
Предусмотрите в договоре (в оферте) свои условия сдачи и приёмки - дистанционные.
Опишите подробно, как и кому сдаёте работу (готовый сайт, например) и кто и как принимает и сообщает Вам о том, что работа принята.
Конечно, здесь очень бы помог электронный документооборот.
Но это уже новая тема.
Успехов!